Air Burkina, Air Gabon, Air Ivoire, Air France, Cameroon Airlines, Delta Airlines et Ghana Airways desservent le Bénin. Le Bénin est aussi actionnaire d'Air Afrique (RK).

Cotonou Cadjehoun (COO) est à 5km à l'ouest de la ville. Des taxis et des limousines desservent la ville (durée du trajet: 15-20 minutes). Parmi les services de l'aéroport il y a une boutique hors taxes, un restaurant, un bar, un bureau de poste (ouvert de lundi à vendredi de 8h00 à 16h00; samedi, dimanche et jours féries de 8h00 à 12h00), un centre d'affaires, un service de soins médicaux ouvert 24h/24 , une banque et un service de location de voitures (Europcar, Loc’auto et Benin Limousine).

Des avions gouvernementales desservent Cotonou, Parakou, Natitingou, Djougou et Kandi. Il est aussi possible de prendre des biplaces charter pour les vols intérieurs.

Le réseau ferroviaire du Bénin s'étend sur environ 600km. Les trains relient Cotonou à Pobé, Ouidah et Parakou. Un service de restauration est proposé sur certaines lignes. Des fauteuils sont disponibles uniquement en première classe et ceci uniquement sur la ligne à destination de Parakou. Les enfants de moins de quatre ans voyagent gratuitement et les enfants de quatre à neuf ans payent demi-tarif.

L'état des routes est satisfaisant. De nombreuses routes reliant Cotonou à Dassa et Parakou à Malanville, sont pavées. Les pistes sont praticables pendant la saison sèche, mais souvent infranchissables pendant la saison des pluies. On roule à droite. Des services de minibus et des taxis de brousse opèrent sur les axes principaux. Les minibus sont meilleur marché mais plus lents. Documentation: Un Permis de Conduire International est exigé.

Les taxis abondent dans les grandes villes. Le tarif de la course doit être convenu à l'avance.