Las líneas aéreas que cubren Bissau son TAP Líneas Aéreas de Portugal, Aeroflot y otras líneas europeas. En Africa occidental, Air Senegal y Air Bissau vuelan a Dakkar

Se puede viajar a Gambia en unas embarcaciones muy precarias. No es recomendable.

El transporte público en Bissau consiste en microbuses y taxis colectivos en las rutas principales y unas furgonetas llamadas kandongas en las rutas rurales. Son relativamente seguros y muy económicos.