TAP Air Portugal bietet regelmäßige Flüge zwischen São Tomé und Libreville (Gabun) mit Anschlussverbindung nach Europa an. Außerdem gibt es Linienflüge von Portugal (Lissabon) und Angola. Die günstigsten Verbindungen von Deutschland, Österreich und der Schweiz sind über Lissabon.

São Tomé (TMS) liegt 5,5 km nordwestlich der Stadt. Shuttlebusse, Minibusse und Taxis fahren in die Stadt.

Der Haupthafen ist São Tomé. Nur wenige internationale Kreuzfahrtlinien und andere Passagierschiffe laufen ihn an.

Linienflugverkehr mit der nationalen Fluglinie Air São Tomé e Príncipe (KY) von São Tomé nach Principe (Flugzeit 40 Min.).

Relativ unregelmäßige Fährverbindungen.

Das 117 km lange Straßennetz ist nur teilweise asphaltiert. Fahrzeuge mit Allradantrieb sind für Fahrten außerhalb der Städte notwendig. Das Busliniennetz ist gut. Taxis sind ebenfalls vorhanden. Mietwagen kann man von verschiedenen Autovermietungen und über das Hotel Miramar (s. Unterkunft) erhalten. Unterlagen: Internationaler Führerschein.